Polo GGB propone servizi di analisi della metilazione del DNA mediante Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS) e array di metilazione. I due approcci permettono di studiare differenze epigenetiche tra campioni e condizioni biologiche, con modalità di copertura e caratteristiche analitiche differenti. Il RRBS combina digestione enzimatica, selezione di frammenti e trattamento con bisolfito per analizzare una porzione del genoma arricchita in siti CpG. Gli array interrogano invece un insieme predefinito di siti, offrendo un approccio standardizzato. La scelta dipende dagli obiettivi, dalla specie, dal materiale disponibile e dalla compatibilità dei sistemi analitici.

Le applicazioni comprendono la ricerca sui meccanismi epigenetici associati a malattie, invecchiamento, sviluppo, differenziamento cellulare e risposta a fattori ambientali. Il servizio può comprendere estrazione e controllo qualità del DNA, preparazione delle librerie e sequenziamento per RRBS oppure processazione dell’array. Le analisi bioinformatiche possono includere controllo qualità, stima dei livelli di metilazione, confronto tra gruppi e identificazione di siti o regioni differenzialmente metilati (DMR), con reportistica dedicata. Contatta Polo GGB per valutare l’approccio e le analisi più adatte al tuo progetto.

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