Polo GGB offre servizi di bulk mRNA sequencing per studiare l’espressione genica in tessuti, colture cellulari e altri campioni biologici. L’analisi restituisce un profilo complessivo dell’espressione nel campione e permette di confrontare condizioni sperimentali, trattamenti o gruppi biologici secondo un disegno di studio appropriato. Il sequenziamento Illumina a letture brevi è indicato per la quantificazione dell’espressione e il confronto tra campioni.

Il sequenziamento Oxford Nanopore a letture lunghe può essere impiegato per approfondire la struttura dei trascritti, le isoforme e lo splicing alternativo. Preparazione delle librerie e analisi vengono scelte in funzione della domanda biologica e della qualità dell’RNA disponibile. Le applicazioni comprendono ricerca biomedica, tossicologia, risposta ai trattamenti, fisiologia vegetale e studi su modelli animali. Il servizio può comprendere controllo qualità dell’RNA, preparazione delle librerie, sequenziamento e analisi bioinformatica.

Quantificazione, espressione differenziale, arricchimento funzionale, analisi delle isoforme e visualizzazioni grafiche (heatmap, PCA, volcano plot) vengono inclusi secondo il piano concordato. I risultati sono accompagnati da reportistica dedicata alle analisi svolte. Contatta Polo GGB per definire campioni, confronti sperimentali e livello di approfondimento.

Per maggiori informazioni clicca qui