Polo GGB offre servizi di miRNA sequencing (miRNA-Seq) per identificare e quantificare microRNA coinvolti nella regolazione post-trascrizionale dell’espressione genica. L’impiego di librerie dedicate agli RNA di piccola taglia permette di studiare i profili dei miRNA noti e de-novo, oltre a caratterizzare eventuali isomiR. Il servizio è indicato per progetti sui meccanismi di regolazione genica, sullo sviluppo e sulla risposta allo stress, oltre che per la ricerca di potenziali biomarcatori. Le applicazioni possono riguardare campioni umani, animali o vegetali, previa valutazione dell’idoneità del materiale e dei riferimenti disponibili. L’analisi di miRNA circolanti richiede una valutazione specifica delle caratteristiche del campione e del protocollo. Il percorso può
comprendere controllo qualità dell’RNA, preparazione delle librerie, sequenziamento e analisi bioinformatica. Le attività includono, secondo il piano concordato, rimozione degli adattatori, filtraggio, mappatura, identificazione e quantificazione dei miRNA e analisi dell’espressione differenziale. La caratterizzazione degli isomiR, la ricerca di candidati miRNA non annotati e la predizione bioinformatica dei geni bersaglio possono essere valutate come approfondimenti dedicati.

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