Polo GGB offre analisi del trascrittoma a singola cellula mediante tecnologia split-and-pool di Parse Biosciences. Il single-cell RNA sequencing permette di distinguere popolazioni cellulari e studiarne i profili di espressione, approfondendo l’eterogeneità che un’analisi complessiva del campione può mascherare. L’approccio utilizza un sistema di indicizzazione combinatoriale, senza incapsulamento delle singole cellule in droplet, e consente di lavorare con cellule o nuclei fissati secondo protocolli compatibili.

Questa modalità facilita l’organizzazione di studi con più campioni e raccolte in momenti diversi, previa definizione delle condizioni di preparazione e conservazione. Il servizio trova applicazione nella caratterizzazione di tessuti e modelli sperimentali, negli studi di sviluppo, immunologia, neuroscienze e ricerca biomedica. Il servizio può comprendere consulenza sul disegno sperimentale, preparazione delle librerie, sequenziamento e analisi bioinformatica.

Quest’ultima può includere controllo qualità, clustering, annotazione delle popolazioni cellulari, analisi dell’espressione differenziale e visualizzazione dei risultati (UMAP(t-SNE) con report personalizzato. Fattibilità, numero di cellule e campioni, profondità di sequenziamento e approfondimenti vengono concordati in funzione del progetto. Il team Polo GGB supporta la definizione del percorso prima dell’avvio delle attività.

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